MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 chromosome

Total Repeats: 7109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017027	CTC	2	6	4332	4337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017027	TCAAA	2	10	4369	4378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017027	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017027	CAA	2	6	7687	7692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017027	AAGA	2	8	7720	7727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017027	GT	3	6	7759	7764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017027	GAT	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017027	T	6	6	8509	8514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017027	ATTT	2	8	8548	8555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017027	CAC	2	6	8607	8612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017027	T	7	7	9204	9210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017027	ATT	2	6	9244	9249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017027	T	6	6	9259	9264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017027	GAC	2	6	9279	9284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017027	TAT	2	6	9323	9328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017027	AT	3	6	9327	9332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017027	TTAT	2	8	9333	9340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017027	ATG	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017027	A	6	6	12993	12998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017027	A	6	6	13034	13039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017027	TTG	2	6	13040	13045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017027	CGC	2	6	15778	15783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017027	TAAT	2	8	15812	15819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017027	TGTA	2	8	15841	15848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017027	A	7	7	15865	15871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017027	AGA	3	9	15889	15897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017027	T	6	6	15916	15921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017027	AAT	2	6	16834	16839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017027	T	6	6	17855	17860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017027	T	8	8	17862	17869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017027	TTA	2	6	17884	17889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017027	TAA	3	9	17895	17903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017027	TG	3	6	17912	17917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017027	AATT	2	8	17920	17927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017027	TTA	2	6	19867	19872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017027	ATC	2	6	19934	19939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017027	TTGT	2	8	19946	19953	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017027	T	6	6	19996	20001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017027	GTAG	2	8	20110	20117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017027	CTT	2	6	20120	20125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017027	ATT	2	6	20175	20180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017027	TGT	2	6	20230	20235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017027	TA	3	6	20268	20273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017027	AATA	2	8	20309	20316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017027	TA	3	6	20438	20443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017027	TGGA	2	8	20460	20467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017027	T	6	6	20496	20501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017027	T	7	7	20549	20555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017027	ATA	2	6	20556	20561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017027	CAA	2	6	20578	20583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017027	TTAAT	2	10	20626	20635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017027	AAG	2	6	20644	20649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017027	T	7	7	20706	20712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017027	TCT	2	6	20722	20727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017027	TTA	2	6	20731	20736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017027	TTTATA	2	12	20748	20759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017027	TGC	2	6	20774	20779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017027	ATTT	2	8	20784	20791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017027	TTGAT	2	10	20860	20869	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017027	CGA	2	6	20981	20986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017027	T	6	6	21036	21041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017027	T	6	6	21054	21059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017027	GAA	2	6	21078	21083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017027	ATATA	2	10	21096	21105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017027	ATT	2	6	21112	21117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017027	TGAA	2	8	21123	21130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017027	TG	3	6	21145	21150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017027	ATT	2	6	21152	21157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017027	A	6	6	21166	21171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017027	AGAA	2	8	23497	23504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017027	AAAG	2	8	23505	23512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017027	A	7	7	24287	24293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017027	T	7	7	24311	24317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017027	A	7	7	29819	29825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017027	T	7	7	29846	29852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017027	TAA	2	6	30979	30984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017027	ATCAT	2	10	30986	30995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017027	GTTT	2	8	31384	31391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017027	CA	3	6	31392	31397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017027	T	6	6	31407	31412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017027	A	7	7	32024	32030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017027	T	6	6	32049	32054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017027	TTGTG	2	10	35237	35246	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017027	TAA	2	6	35252	35257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017027	T	6	6	35264	35269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017027	TAT	3	9	35286	35294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017027	A	6	6	36529	36534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017027	AAGA	2	8	37425	37432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017027	ATGAA	2	10	37446	37455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017027	A	6	6	37454	37459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017027	AGA	2	6	37469	37474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017027	GTG	2	6	37476	37481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017027	CCT	2	6	37510	37515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017027	GTG	2	6	37615	37620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017027	CCT	2	6	37649	37654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017027	GTG	2	6	37742	37747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017027	CCT	2	6	37776	37781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017027	TTG	2	6	37849	37854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017027	GTG	2	6	37859	37864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017027	CCT	2	6	37893	37898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017027	TGT	2	6	37939	37944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017027	ATT	2	6	37959	37964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017027	CAA	2	6	37978	37983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017027	A	7	7	37992	37998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017027	T	6	6	38034	38039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017027	T	6	6	38080	38085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017027	TG	3	6	39607	39612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017027	TAT	2	6	39621	39626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017027	GCATG	2	10	39679	39688	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017027	GTC	2	6	39695	39700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017027	CCA	2	6	39720	39725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017027	AT	3	6	39740	39745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017027	T	7	7	39749	39755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017027	A	6	6	39759	39764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017027	ATT	2	6	41035	41040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017027	T	6	6	41082	41087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017027	TGC	2	6	41224	41229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017027	TCA	2	6	41241	41246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017027	ATC	2	6	41258	41263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017027	A	6	6	41276	41281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017027	T	6	6	41303	41308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017027	AAT	2	6	41352	41357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017027	TGA	2	6	41366	41371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017027	CTTT	2	8	41843	41850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017027	A	6	6	41858	41863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017027	ATA	2	6	42742	42747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017027	A	6	6	42747	42752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017027	A	7	7	44081	44087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017027	TAA	2	6	44125	44130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017027	TGT	2	6	45005	45010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017027	AAT	2	6	46210	46215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017027	GCT	2	6	46218	46223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017027	AGC	2	6	46229	46234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017027	AACAA	2	10	47770	47779	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017027	CGGT	2	8	48167	48174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017027	GTATT	2	10	48949	48958	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017027	A	7	7	48994	49000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017027	TAAAA	2	10	49070	49079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017027	A	6	6	49096	49101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017027	TGT	2	6	49107	49112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017027	A	6	6	49983	49988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017027	GCC	2	6	49993	49998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017027	A	7	7	50009	50015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017027	TTA	2	6	50020	50025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017027	ATT	2	6	50636	50641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017027	A	6	6	50694	50699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017027	TTG	2	6	50741	50746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017027	T	6	6	50826	50831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017027	T	6	6	50837	50842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017027	TCTTTT	2	12	50846	50857	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_017027	ATG	2	6	50995	51000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_017027	TA	3	6	124511	124516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017027	CAT	2	6	124619	124624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_017027	A	8	8	124724	124731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017027	AGG	2	6	124775	124780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_017027	TTG	2	6	124934	124939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017027	TGA	2	6	124966	124971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017027	AGG	2	6	125039	125044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_017027	TAGA	2	8	125108	125115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_017027	TAT	2	6	125417	125422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017027	TAT	3	9	125492	125500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017027	TGA	2	6	125572	125577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_017027	TAA	2	6	125730	125735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_017027	AG	3	6	126953	126958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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